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氨基酸的脱氨与氨基酸氧化酶

氨基酸失去氨基称为脱氨,是机体氨基酸分解代谢的第一步。绝大多数氨基酸先脱氨生成α-酮酸,再氧化分解或转化为其他物质。脱氨可分为氧化脱氨和非氧化脱氨两类,前者普遍存在,后者主要存在于某些微生物。

氧化脱氨是指氨基酸在氨基酸氧化酶催化下脱氢生成亚氨基酸,再水解生成酮酸和氨。脱下的氢由黄素蛋白传递给氧,生成过氧化氢。此类酶多以分子氧为电子受体,所以命名为氧化酶。氨基酸氧化酶大致分为三类:L-氨基酸氧化酶、D-氨基酸氧化酶和专一性氨基酸氧化酶。

L-氨基酸氧化酶作用机制。引自J Venom Anim Toxins Incl Trop Dis. 2014

L-氨基酸氧化酶(L-amino-acid oxidase,LAAO,EC1.4.3.2)可以催化多数L-氨基酸脱氨,但不催化甘氨酸、丝氨酸、苏氨酸、赖氨酸等。几乎所有的LAAO都是二聚体结构的黄素蛋白,每个亚基都含有黄素单核苷酸(FMN)或黄素腺嘌呤二核苷酸(FAD)辅因子。人的LAAO以FMN为辅因子。

通常在蛇毒中含有大量L-氨基酸氧化酶,称为SV-LAAO。LAAO中的黄素是许多蛇毒的特征性黄色,其产生的过氧化氢造成的氧化应激是其毒性的重要原因。

SV-LAAO具有凋亡诱导、细胞毒性、诱导和/或抑制血小板聚集、出血、溶血、水肿、以及抗菌、抗寄生虫和抗HIV活性。目前SV-LAAO的抗肿瘤活性也有很多报道,如抑制肿瘤细胞增殖,诱导肿瘤细胞凋亡等。有研究者认为sv-LAAO对癌细胞具有优先的细胞毒性作用,是潜在的基于ROS的抗癌药物(Toxicon. 2018 Mar 15;144:7-13.)。

眼镜王蛇LAAO诱导肿瘤细胞凋亡。引自Int J Med Sci. 2014

D-氨基酸氧化酶(DAAO,EC1.4.3.3)用于D-氨基酸的氧化代谢。DAAO也属于黄素酶类,人体的DAAO以FAD为辅因子。在工业上,DAAO可以用来拆分外消旋氨基酸,催化抗生素合成等。

DAAO催化D-氨基酸氧化。引自Front Mol Biosci. 2018

D-氨基酸虽然不能构成蛋白质,但也有重要生理功能。例如,D-丝氨酸可以激活N-甲基D-天冬氨酸受体(N-methyl-D-aspartate receptor,NMDAR),从而调节大脑功能,如学习、记忆等。

D-丝氨酸通过NMDAR调控大脑功能。引自Biol Psychiatry. 2017

饶毅课题组曾经报道过果蝇肠道上皮细胞可以产生D-丝氨酸,通过NMDA受体促进睡眠。致幻剂苯环利定(PCP,又称天使之尘)就是一种NMDAR的非竞争性拮抗剂,会诱发精神分裂。

在中枢神经系统中,D-丝氨酸的分解代谢主要由DAAO负责。有研究认为DAAO水平与D-丝氨酸水平及认知缺陷的严重程度相关。

专一性氨基酸氧化酶用于氧化特定氨基酸,如甘氨酸氧化酶、L-赖氨酸氧化酶L-谷氨酸脱氢酶等。L-赖氨酸氧化酶(L-Lysine oxidase,EC 1.4.3.14)在赖氨酸的降解过程中起作用,催化哌可酸支路的第一步反应,在脑的赖氨酸代谢中起重要作用。

赖氨酸氧化酶催化的反应。

谷氨酸脱氢酶(GDH)分布广泛,活力高,在氨基酸脱氨过程中起着非常重要的作用。很多氨基酸的脱氨其实是通过转氨作用转移给α-酮戊二酸生成谷氨酸,最终由GDH完成的,称为联合脱氨。

谷氨酸脱氢酶催化的反应。引自themedicalbiochemistrypage

GDH是同六聚体,以NAD或NADP为辅酶(所以称为脱氢酶)。一般低等生物的GDH对NAD 或NADP具有严格的特异性,NAD依赖性GDH主要起分解作用,而NADP特异性酶参与生物合成,编号分别为EC1.2.1.2和EC1.2.1.4。

谷氨酸脱氢酶结构。引自Biology (Basel). 2017

哺乳动物GDH具有双辅酶特异性(EC1.2.1.3),并具有复杂的活性调节机制,比如受到GTP别构抑制,被ADP和亮氨酸激活。复杂的调控机制说明它在代谢途径中处于关键位置。

这个反应连接着三羧酸循环,与糖、脂代谢密切相关。在分解方向上,GDH可以氧化谷氨酸,进入三羧酸循环,可提供能量,也可转变为乳酸或脂肪酸;在合成方向上,GDH可以合成谷氨酸,并进一步形成谷氨酰胺,同时还能减少氨对细胞的毒性。

谷氨酸脱氢酶与三羧酸循环。引自Biology (Basel). 2017

与能量代谢相关的酶一般都受细胞能荷调节。ATP和GTP对谷氨酸合成起正变构调节作用,而对氧化分解方向起负调节作用。除别构调节外,GDH也受到共价修饰调节,比如磷酸化、乙酰化和ADP-核糖化等。

谷氨酸脱氢酶的共价修饰调节。引自Biology (Basel). 2016

灵长类有两种GDH,称为GDH1和GDH2,分别由GLUD1和GLUD2基因编码。人类的GLUD1位于10号染色体上,有18个外显子。而GLUD2位于X染色体,没有内含子,被认为是逆转座的结果。现在认为GDH2的出现对人类是有利的,因为它具有不同的组织分布和调控方式,可以更灵活地应对环境变化,特别是在神经组织中。

GDH1广泛分布,而GDH2主要在神经组织、肾和类固醇合成器官(如睾丸)中表达。GDH2不受GTP抑制,所以星形胶质细胞GDH2在强烈的兴奋性神经传递条件下继续起作用,从而可以承受更高的谷氨酸负荷。

谷氨酸在神经传递过程中的作用。引自J Neurochem. 2016

谷氨酸是兴奋性神经递质,在很多神经变性疾病中会出现GDH活性降低,导致谷氨酸浓度升高,由于兴奋性毒性而导致脑损伤。而GDH活性过高也会损伤大脑。GDH过表达会导致一些基因上调,包括与氧化应激、炎症、细胞损伤有关的基因,以及与帕金森症(PD)发生有关的α-突触核蛋白基因等。有趣的是,GDH2受到雌激素抑制,所以女性PD患者对GDH过度活跃有抵抗作用,可能导致对PD的早期保护。

非氧化脱氨包括还原脱氨、水解脱氨、脱水脱氨等多种。还原脱氨是在严格无氧时由氢化酶催化生成羧酸和氨。水解脱氨由水解酶催化,生成α-羟酸和氨。

丝氨酸和苏氨酸可以在脱水酶催化下产生双键,重排成亚氨基酸后自发水解生成酮酸和氨。脱水酶以磷酸吡哆醛为辅基。半胱氨酸在脱硫氢基酶催化下脱去硫化氢,重排、水解后生成丙酮酸和氨,称为脱巯基脱氨。还有一种氧化-还原脱氨,是两个氨基酸一个氧化,一个还原,脱去两个氨,生成酮酸和脂肪酸。

参考文献:

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