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B-ALL遗传学风险分层(NCCN指南2023版)

本文整理了急性淋巴母细胞白血病和儿童急性淋巴母细胞白血病(NCCN指南2023版)中关于B-ALL遗传学风险分层的内容,并在文末讨论了几个遗传学概念,感兴趣的老师可以一起学习一下。

一、ALL中常见的染色体和分子学异常(急性淋巴母细胞白血病版)

备注:

1.异常仅见于T-ALL;其它异常仅见于或主要见于B-ALL。

2.包括以下基因融合和突变:ABL1、 ABL2、 CRLF2、 CSF1R、 EPOR、 JAK1、JAK2、 JAK3、 TYK2、 PDGFRβ、 PDGFRα、 FGFR、 EBF1、 FLT3、 IL7R、NTRK3、 PTL2B 和 SH2B3。

3.包括细胞因子受体和RAS信号通路活化突变(NRAS、KRAS、FLT3、IL7R、JAK3、JAK1、SH2B3和BRAF)和造血发育因子失活突变(GATA3、ETV6、RUNX1、IKZF1和EP300)。

二、B-ALL细胞遗传学和分子学预后风险分层(急性淋巴母细胞白血病版)

B-ALL遗传学风险分层(NCCN指南2023版)

备注:

1.也许有用的FISH探针:用于检测超二倍体的4号,10号和17号染色体着丝粒探针;用于检测隐匿性t(12;21)的双色探针,该探针也可以用于检测(RUNX1基因≥5个拷贝);用于检测BCR::ABL1和KMT2A重排的探针;用于检测ABL1、ABL2和重排的探针;用于检测位于9p21.3的缺失的探针;用于检测隐匿性t(X;14)(p22;q32)/ t(Y;14)(p11;q32)IGH::CRLF2重排的探针;以及用于检测JAK2重排的探针。

2.t(12;21)(p13;q22)易位通过核型检测是典型的隐匿性,需要用FISH或PCR方法鉴定。

3.推荐用血液粒细胞做间期FISH检测BCR::ABL1转录本,以便区分新发的急变期CML(BP-CML)和新发的Ph阳性ALL。

4.IKZF1 plus,是指IKZF1缺失合并、、PAX5或PAR1缺失,且不存在ERG缺失,同样的,这些异常伴22q11.22缺失在儿童B-ALL中尤其与预后不良相关。

5.还有一些其他结果染色体数目不<44条,但也许等同于亚二倍体,并有着相同的预后。区分真的亚二倍体(true )和隐藏的亚二倍体是重要的,后者是由亚二倍体倍增产生的。 AJ, et al. ;238:62-68.

6.或者定义为DNA指数小于标准定义的阈值或其它明显的亚二倍体证据。亚二倍体ALL也经常与功能性缺失TP53突变及Li-综合征有关。

7.包括IGH::IL3重排

8.Jain N, et al. Blood 2017;129:572-581; KG, et al.N Engl J Med 2014;371:1005-1015

9. CG, et al. N Engl J Med 2009;360:470-480; M, et al. J Clin Oncol 2018;36:1240-1249

10.新的证据表明DUX4重排预后良好。另外存在DUX4重排、IKZF1改变的病例并不意味着预后不良。三、B-ALL遗传学风险分组(儿童急性淋巴母细胞白血病版)

B-ALL遗传学风险分层(NCCN指南2023版)

备注:

1.新出现的证据表明未列在此表格的一些分子标记物可能影响预后。专家组将对这些数据进行审查,并在它们可用时更新。

2.新出现的证据建议划分新的亚型:

(1)ETV6::RUNX1样;

(2)其他已定义的遗传学异常:DUX4、MEF2D、和NUTM1的重排;IG::MYC融合;PAX5改变和PAX5 p.P80R。

需要进一步的验证性研究来评估与这些变异相关的风险。

3.或者定义为DNA指数小于标准定义的阈值或其它明显的亚二倍体证据:近单倍体(24-31条染色体);低亚二倍体(32-39条染色体);或高亚二倍体(40-43条染色体)。低亚二倍体ALL也经常与功能性缺失TP53突变及Li-综合征有关。

4.还有一些其他结果染色体数目不<44条,但也许等同于亚二倍体并有着相同的预后。区分真的超二倍体(true )和隐藏的亚二倍体是重要的,后者是由亚二倍体倍增产生的。单核苷酸多态性(SNP)芯片或全基因组测序通过检测杂合型缺失(LOH)可以区分真的超二倍体和隐藏的亚二倍体。 AJ, Shago M, FM, et al. : acute (ALL) ALL in : A from the 's Group. Genet 2019;238:62-68.

5. RC, CG, Chen IM, et al. of CRLF2 is with of JAK , of IKZF1, / , and a poor in B- acute . Blood 2010;115:5312-5321。

6.IKZF1 plus,是指IKZF1缺失合并、、PAX5或PAR1缺失,且不存在ERG缺失,同样的,这些异常伴22q11.22缺失尤其与预后不良相关。然而,存在DUX4重排伴IKZF1改变并不意味着预后不良。 CG, Su X, Zhang J, et al. of IKZF1 and in acute . N Engl J Med 2009;360:470-480; M, E, M, et al. a new - very-poor in B-cell acute .J Clin Oncol 2018;36:1240-1249. DS, Meyer JA, Mason CC, et al. of focal 22q11.22 and IKZF1 with acute . JAMA Oncol 2021;7:1521-1528。

四、讨论

高超二倍体,在血液学中亦常被称为超二倍体,是指染色体数目>50条,通常<66条的核型。在ISCN中,超二倍体核型的染色体数目被定义为47条~57条。

亚二倍体,在血液学中是指染色体数目<44条的核型。在ISCN中,亚二倍体核型的染色体数目被定义为35条~45条。近单倍体,在血液学其染色体数目被定义为24条~31条。在ISCN中,近单倍体核型的染色体数目被定义为≤34条。

B-ALL遗传学风险分层(NCCN指南2023版)

复杂核型,在B-ALL中是指5个或以上染色体异常。在AML中,复杂核型是指≥3个不相关的染色体异常,且缺少其它分类定义的重现性遗传学异常;不包括含有三个或多个染色体三体(或多体)且不伴结构异常的超二倍体核型。

复杂核型:≥3个不相关的染色体异常,且缺少其它分类定义的重现性遗传学异常;不包括含有三个或多个染色体三体(或多体)且不伴结构异常的超二倍体核型。

王当锋,公众号:细胞遗传自习室AML(非APL)患者的遗传学风险分层(NCCN指南2023版)

关于隐藏的亚二倍体,是需要与真的亚二倍体(true )区分,还是需要与真的超二倍体(true )区分?个人认为是需要与真的超二倍体区分。因为隐藏的亚二倍体是通过亚二倍体倍增产生的,与亚二倍体在染色体数目上有明显差异,但与真的超二倍体在染色体数目上类似,所以需要通过单核苷酸多态性(SNP)芯片或全基因组测序检测杂合型缺失(LOH)来区分。

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B-ALL遗传学风险分层(NCCN指南2023版)

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