为了研究某个基因在体内的功能,通常需要将该基因敲除,再观察其出现哪些异常现象,推测该基因具有何种功能。
然而,有些基因对小鼠个体很重要,敲除后会导致小鼠不能存活、不能正常发育、繁殖能力异常,这时就不能进行全身性基因敲除。或者,研究者想研究某个基因仅在某个器官、某个时期缺失后有什么功能,也是不能用全身性基因敲除的。针对这类研究,我们需要使用条件性基因敲除的方法进行研究。
1“条件性”是指什么?
条件性基因敲除的“条件性”,是指在基因敲除的“时”、“空” 。
“时” 即时间、阶段,是指可以人为决定基因在什么时间、或什么发育阶段发生敲除,在此之前,基因仍可以发挥正常的功能。
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▲小鼠生长时间表
“空” 即空间、部位,是指可以人为决定基因在哪种组织、哪种器官,在其他的部位,该基因仍可以发挥正常的功能。
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▲小鼠内部结构图
若希望“条件性的”基因敲除可遗传给后代,必须同时满足以下3个条件:
①基因敲除后小鼠仍具有正常生殖能力;
②基因敲除发生在生殖细胞内;
③小鼠交配行为发生在基因敲除之后。
2条件性基因敲除的两个强有力的工具
条件性基因敲除基于两个强有力的工具:
一是Cre/loxP重组酶系统;
二是基因打靶技术。
●Cre/loxP重组酶系统:
Cre重组酶来自于噬菌体P1,能够催化两个34bp长的loxP识别位点间的重组。
loxP由8bp的中心序列和两侧的13bp的回文序列构成,中心序列的不对称性赋予loxP位点以方向。
Cre/loxP系统用于条件性敲除小鼠已经超过20年,cre小鼠资源比较丰富,仅Jackson lab上就有近800种Cre小鼠,MGI网站上更是收录了超过3000种Cre小鼠,几乎涵盖了各种“时”、“空”的条件,因此制备条件性基因敲除小鼠首选Cre/loxP系统。
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▲loxP序列
除了Cre/loxP系统, 另外两种Flpe/FRT系统、Dre/Rox系统也可以用于位点特异的基因重组/敲除,这两个系统的作用机制和Cre/loxP系统类似,但重组效率稍低。
3Cre/loxP系统介导的基因重组的方式
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Cre/loxP系统介导的4种基因重组方式都是可逆的,但第①种重组方式更倾向于删除loxP间的序列。
条件性基因敲除正是利用了第①种重组方式。首先通过基因打靶的方法将2个loxP序列置于某个基因的重要外显子的两侧,再通过小鼠交配的方法,在“条件性”表达Cre酶的细胞内,将重要外显子删除,从而使该基因发生敲除。而未表达Cre酶的细胞内,该基因将不受影响,正常表达。
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▲利用同源重组的方法引入loxP的过程。
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